Al comenzar, tendrás un espacio de trabajo vacío. (Si ya dibujaste antes una molécula y quieres comenzar otra, elige en el menú Archivo > Nuevo o pulsa el botón
)
Al principio todos los átomos que añadas serán de carbono; no te preocupes, es mejor cambiarlos a otro elemento una vez que estén trazados.
Si la molécula contiene anillos, generalmente es mejor empezar por ellos.
Utiliza las plantillas existentes en la barra de botones:
pulsa en uno de los botones ,
luego pulsa en el espacio de trabajo una vez para cada anillo;
cuando termines, pulsa en el botón .
Para
trazar anillos con un solo átomo en común, cuando estés colocando el segundo anillo haz clic sobre uno de los átomos del primero (que se resaltará).
Para
trazar anillos condensados, cuando estés colocando el segundo anillo haz clic sobre uno de los enlaces del primero (se resaltarán los dos átomos afectados).
A continuación, dibuja las cadenas, un enlace cada vez: pulsa en el botón (si no está ya seleccionado) y luego en el átomo al cual quieres enlazar otro átomo nuevo. Para unir con un enlace dos átomos ya existentes, pulsa sobre el primero y, sin soltar el botón del ratón, arrastra hasta alcanzar el segundo átomo.
Para convertir un enlace sencillo en doble o triple, pulsa sobre el enlace sencillo usando la herramienta . También puedes usar y para añadir información estereoquímica a un enlace ya existente.
Para modificar el elemento químico de un átomo ya existente, pulsa en uno de los botones etc. y luego pulsa sobre el (los) átomo(s) cuya identidad quieras cambiar.
Si necesitas otros elementos, puedes usar la tabla periódica
Edición
Colocando el puntero del ratón sobre cada uno de los botones de las barras de herramientas* podrás ver un rótulo flotante que te indica su función.
(* en la ventana de JCP, no aquí)
Dibujar o mover:
Con se activa el modo de dibujo, añadiendo enlaces.
Para mover o desplazar átomos, basta con que arrastres una vez seleccionados.
Seleccionar átomos:
Puedes seleccionar un solo átomo pulsando sobre o y a continuación haciendo clic sobre el átomo.
Para seleccionar un grupo de átomos, pulsa sobre o y traza una línea o un rectángulo que rodee a los átomos deseados.
Eliminar átomos:
Para borrar un átomo, pulsa sobre él después de haber elegido la herramienta .
Para borrar varios átomos, selecciónalos con o y luego pulsa sobre cualquiera con .
Deshacer acciones:
Para cancelar la última acción realizada, pulsa sobre . (Puede usarse repetidas veces.)
Para rehacer la última acción cancelada, pulsa en .